Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms