Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP54Q7Z3B4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms