Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
HECW1Q76N89 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
HECW1Q76N89 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms