Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP45Q70EL2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms