Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR3Q6ZTQ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR3Q6ZTQ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms