Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 744.1 ms