Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD9BQ6WBX8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms