Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms