Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC171Q6TFL3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms