Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCD3Q6STE5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms