Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTR9Q6PD62 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTR9Q6PD62 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms