Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK5Q6P3R8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEK5Q6P3R8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms