Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms