Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf53Q5VUE5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms