Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC38Q5VT99 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms