Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP350Q5VT06 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP350Q5VT06 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP350Q5VT06 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms