Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms