Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSL3PQ5NE16 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSL3PQ5NE16 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms