Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms