Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SAMD9Q5K651 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SAMD9Q5K651 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SAMD9Q5K651 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms