Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FRMPD3Q5JV73 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD3Q5JV73 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms