Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD3Q5JSP0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms