Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms