Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms