Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS9Q3SYG4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms