Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
KLHL40Q2TBA0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms