Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYSND1Q2T9J0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms