Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM1Q2NKQ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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