Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKIDA1Q1XH10 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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