Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF1Q17RB8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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