Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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KCNMB1Q16558 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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KCNMB1Q16558 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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KCNMB1Q16558 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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KCNMB1Q16558 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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KCNMB1Q16558 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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KCNMB1Q16558 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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KCNMB1Q16558 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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KCNMB1Q16558 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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KCNMB1Q16558 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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