Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF1Q15637 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF1Q15637 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF1Q15637 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF1Q15637 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF1Q15637 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF1Q15637 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF1Q15637 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF1Q15637 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF1Q15637 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SF1Q15637 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF1Q15637 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF1Q15637 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF1Q15637 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF1Q15637 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF1Q15637 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF1Q15637 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF1Q15637 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF1Q15637 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF1Q15637 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF1Q15637 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF1Q15637 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF1Q15637 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF1Q15637 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF1Q15637 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF1Q15637 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF1Q15637 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF1Q15637 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF1Q15637 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF1Q15637 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF1Q15637 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SF1Q15637 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SF1Q15637 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF1Q15637 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SF1Q15637 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF1Q15637 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF1Q15637 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF1Q15637 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF1Q15637 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF1Q15637 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF1Q15637 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF1Q15637 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF1Q15637 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SF1Q15637 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF1Q15637 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SF1Q15637 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SF1Q15637 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SF1Q15637 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SF1Q15637 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF1Q15637 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF1Q15637 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SF1Q15637 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF1Q15637 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF1Q15637 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF1Q15637 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF1Q15637 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF1Q15637 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF1Q15637 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF1Q15637 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF1Q15637 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF1Q15637 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF1Q15637 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF1Q15637 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF1Q15637 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SF1Q15637 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF1Q15637 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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