Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIX1Q15475 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
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