Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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