Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCOLCEQ15113 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCOLCEQ15113 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms