Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SMCO1Q147U7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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