Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBX2Q14781 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX2Q14781 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX2Q14781 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms