Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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