Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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