Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDGQ13569 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGQ13569 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDGQ13569 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDGQ13569 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDGQ13569 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDGQ13569 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDGQ13569 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDGQ13569 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TDGQ13569 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TDGQ13569 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDGQ13569 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TDGQ13569 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGQ13569 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGQ13569 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGQ13569 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGQ13569 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGQ13569 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGQ13569 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGQ13569 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGQ13569 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGQ13569 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGQ13569 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGQ13569 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGQ13569 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGQ13569 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGQ13569 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGQ13569 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGQ13569 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGQ13569 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGQ13569 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGQ13569 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGQ13569 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGQ13569 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGQ13569 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGQ13569 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGQ13569 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGQ13569 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGQ13569 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGQ13569 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGQ13569 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGQ13569 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGQ13569 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGQ13569 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGQ13569 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGQ13569 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGQ13569 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGQ13569 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGQ13569 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGQ13569 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGQ13569 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGQ13569 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGQ13569 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGQ13569 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDGQ13569 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGQ13569 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGQ13569 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGQ13569 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGQ13569 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGQ13569 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGQ13569 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGQ13569 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDGQ13569 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDGQ13569 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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