Protein–RNA interactions for Protein: Q13503

MED21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED21Q13503 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED21Q13503 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED21Q13503 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED21Q13503 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED21Q13503 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED21Q13503 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED21Q13503 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED21Q13503 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MED21Q13503 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED21Q13503 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED21Q13503 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED21Q13503 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED21Q13503 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED21Q13503 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MED21Q13503 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED21Q13503 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED21Q13503 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MED21Q13503 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED21Q13503 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED21Q13503 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED21Q13503 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED21Q13503 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED21Q13503 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED21Q13503 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED21Q13503 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED21Q13503 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED21Q13503 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED21Q13503 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED21Q13503 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED21Q13503 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED21Q13503 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED21Q13503 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED21Q13503 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED21Q13503 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED21Q13503 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED21Q13503 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED21Q13503 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED21Q13503 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED21Q13503 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED21Q13503 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED21Q13503 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED21Q13503 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED21Q13503 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED21Q13503 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED21Q13503 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED21Q13503 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED21Q13503 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED21Q13503 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED21Q13503 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms