Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCIRG1Q13488 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
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