Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LSAMPQ13449 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LSAMPQ13449 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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