Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
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