Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PMS2P3Q13401 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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