Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE3BQ13370 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
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