Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
GRIN2BQ13224 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GRIN2BQ13224 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
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