Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAA1Q13131 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA1Q13131 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA1Q13131 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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