Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TRAF3Q13114 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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TRAF3Q13114 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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