Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRDNQ13061 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRDNQ13061 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRDNQ13061 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
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